Después de estos datos inespecificos se encuentra la fase neurológica aguda, que pueden ser de dos tipos:
- La paralitica o muda
- La furiosa
Paralitica o muda
Se caracteriza por una parálisis que inicia a partir del sitio de penetración del virus, va ascendiendo hasta llegar al cerebro, con una parálisis flácida ascendente, que llega a la cara y a los nervios craneales, y producir la muerte.
Furiosa
Se observa en mamíferos carnívoros y se debe a las lesiones a nivel del encéfalo.
Se caracteriza por agitación, en el individuo se encuentra muy inquieto, hiperactividad, con conducto extraña y empieza a manifestarse dolor faríngeo, debido a un espasmo intenso en la faringe, dificultando la deglución- primero en deglutir sólidos y finalmente cualquier cosa- y esto se basa en el termino hidrofobia.
Hay presencia de datos como:

- Rigidez de nuca
- espasmos inspiratorios
- manifestación en la afectación meningea
- afección de los pares cranelaes
- hiperrflexia o arreflexia
- aerofobia

La rabia al no tratarse se va deteriorando de manera progresiva que puede llegar afectar otros sitos, produciendo complicaciones en el organismos: miocarditis, problemas respiratorios, deterioros mentales y neurológicos como la encefalitis, llegando así a un estado de coma y finalmente la muerte.


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